Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD40Q6AI12 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms