Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms