Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms