Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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