Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ME3Q16798 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ME3Q16798 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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ME3Q16798 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ME3Q16798 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
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