Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN3Q16667 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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