Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC6Q16204 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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