Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
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