Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NWD1Q149M9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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