Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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