Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTTNQ14247 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTTNQ14247 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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