Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EXOSC2Q13868 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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