Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RUNX3Q13761 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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