Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALCAMQ13740 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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