Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEUROD1Q13562 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
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