Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRQ13535 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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