Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMAD4Q13485 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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