Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLF1Q13351 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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