Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SGCGQ13326 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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