Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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NR1H3Q13133 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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