Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
STRN3Q13033 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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