Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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