Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BNIP3Q12983 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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