Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD4Q12950 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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FOXD4Q12950 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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