Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB40BQ12829 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB40BQ12829 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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