Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HMGXB3Q12766 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HMGXB3Q12766 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms