Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCRN3Q0VDG4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms