Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBBP4Q09028 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBBP4Q09028 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms