Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DEUP1Q05D60 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms