Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms