Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms