Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELNP78509 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELNP78509 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RELNP78509 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RELNP78509 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms