Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms