Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIK1P57059 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms