Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms