Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP7P55210 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP7P55210 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP7P55210 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP7P55210 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP7P55210 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP7P55210 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP7P55210 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP7P55210 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP7P55210 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP7P55210 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP7P55210 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP7P55210 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms