Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTPAP49638 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTPAP49638 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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