Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A3P48764 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms