Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms