Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME1P48163 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ME1P48163 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ME1P48163 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms