Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms