Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAP2P40123 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAP2P40123 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAP2P40123 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAP2P40123 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAP2P40123 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAP2P40123 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAP2P40123 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAP2P40123 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAP2P40123 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAP2P40123 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms