Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAEP38570 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms