Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms