Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA6P31267 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms