Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA10P31260 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms