Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5DP30049 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5DP30049 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms