Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD34P28906 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD34P28906 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD34P28906 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms