Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHATP28329 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHATP28329 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHATP28329 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHATP28329 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHATP28329 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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