Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSFA2P28290 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSFA2P28290 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms